2、共聚焦針孔的運用，有效的消除了焦平面上下散射光，提高軸向分辨率。

3、點光源激光的應用，對熒光素能達到有效的激發，激發的特異性高，降低對熒光的淬滅，增強側向分辨率。

4、雙光子的應用，相對較低平均功率的紅外激發，大大減低對活細胞的損傷;熒光激發高度聚焦在焦點處，可避免了焦點以外的光漂白(Photobleaching)和光毒(cytotoxicity)作用，延長觀察時間，是用于活細胞跟蹤的方法。

5、脈沖激光散射和吸收程度小，透射性強，對厚樣品的穿透可達400um，是對厚的組織分析的好方法。

6、結合META新技術，尤其對熒光蛋白成像具有更方便的效果。